Itt látható a Pantokrator monostor (ma Molla Zeyrek-mecset) kriptája. Ez a kripta, amelyben a Komnénosz-dinasztia császárait és császárnőit temették II. János Komnénosz császártól kezdődően, ma is nagyon jól áll, de ugyanez sajnos már nem mondható el a szarkofágokról és az eltemetett uralkodókról, mert ezeket a negyedik keresztes hadjárat során (a pápisták) nagyon kíméletlenül kirabolták, a balzsamozott testeket pedig a tűzbe vetették, vagy más módon megsemmisítették. I. Manuél Komnénosz császár fekete márvány szarkofágjának darabjai ma Velencében, a Szent Márk-bazilikában beépítve találhatók, a MAGYAR SZÁRMAZÁSÚ SZENT IRÉN (Piroska) CSÁSZÁRNÉ szarkofágja pedig ma a Hagia Szophia első előcsarnokában áll. A többi szarkofág vagy megsemmisült, vagy apró darabokban szétszórva található az régészeti múzeumban, stb. A kriptát ma is meg lehet látogatni, de nem mindenki mehet le a mélyébe. A monostorterület általában véve nagyon jó állapotban van, a velenceiek ezt használták főhadiszállásukként, majd az oszmánok mecsetté alakították át az épületet. Nem pontosan tudni, hogy a kriptát akkor mire használták, de legvalószínűbb, hogy raktárként vagy pincéül szolgált.
